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1、 多事之夜
一名男子在浴缸里戏剧般地举枪自杀，男子手中握有一个录音机，在录音机里他留下了一番忏悔的话语。赌城拉斯维加斯的犯罪现场实验室接手此案，以葛里森为首的夜班组具体负责这个案子。尼克和黑人沃瑞克都是夜班组的主干力量，两人为谁先升职打了一个赌。凯瑟林是组里唯一的女性，离异的凯瑟林带有一个女儿。刚毕业的霍丽被分进夜班组跟随大家工作。一个流浪汉死在了一户人家门口，男主人称自己为了保护家人而开枪自卫，所以不得不打死流浪汉。第三个蹊跷的案子是一桩诈骗抢劫，一个在赌场玩乐的游客被一个年轻女子用迷药麻醉拿走了身上的所有财务。沃瑞克从流浪汉鞋带的维系法上推断出，流浪汉的鞋子是在死后被他人穿上去的，从而揭穿了男主人的谎言。通过鞋里的脚趾甲碎片，沃瑞克推断出有过打斗，男主人承认了自己杀害了流浪汉。浴缸自杀男子的家人听了自杀者的录音带，却说发现说话的人不是死者本人，死者是被人杀害的。葛里森根据录音机上的指纹追查到做模型的米兰达，但是最终发现米兰达的指纹留在了他做的手工模型上，罪犯利用了模型上的指纹进行了栽赃。此案最终成了悬案。尼克则通过麻醉药查到了骗取钱财的妓女。由于沃瑞克的失误，将实习探员霍丽一人留在犯罪现场调查取证。霍丽遭遇返回现场的嫌疑犯，被枪击至重伤。沃瑞克受到法官交给他的5000元进行球赛赌博的钱，由于粗心大意他下错了注。
2、 好手入列
一对在赌场玩吃角子老虎机的情侣意外地中了百万大奖，两人兴奋地住进了总统套房。进入套房之后，男人随即让女人滚蛋，他不打算让女人与之分享赢来的钱。第二天，男子坠楼身亡。葛里森根据死者戴着眼镜分析出，死者不是自杀。霍丽重伤不治而死，沃瑞克内疚无比。犯罪实验室的头头布拉斯调去当凶杀组，葛里森接替了他。葛里森让凯瑟林去调查霍丽的案子，自己和尼克调查百万富翁坠楼案，沃瑞克被迫放假反省。葛里森的朋友莎拉也是一名犯罪现场调查员，莎拉赶来赌城协助工作，她加入了霍丽案的调查。葛里森和尼克做了若干假人进行试验，最终确认了百万富翁是从楼顶被人推下摔死的。凯瑟林和莎拉通过子弹弹道分析，确认了霍丽是被自己的配枪所杀。而赋闲在家的沃瑞克却被输钱的法官追着要求还债。葛里森通过赌场的监控录像发现了另外嫌疑犯，这名嫌疑犯脚上沾满了楼顶的特殊灰尘，从而暴露了自己。不过经过调查，那男人上楼只是想自杀。凯瑟林通过霍丽案现场遗留的传呼机找到了嫌疑犯，凯瑟林假意要求约会骗得了嫌疑犯的信任。布拉斯带领一队警员在路边旅馆抓获了杀害霍丽的嫌疑犯。法官要求沃瑞克替他偷盗罪案证据，作为投注失败的补偿。葛里森调查了坠楼死者的手表，通过上面残存的纤维将推人下楼的真凶-女友抓获。沃瑞克经过激烈的思想斗争，终于站出来检举了黑心的法官。
3、 沙漠惊魂
赌城旁的沙漠里，一个男子将一个女人装进木箱埋进土地里，随后向女人的丈夫敲诈了巨额赎金。葛里森劝说女人丈夫，说CSI探员一定会即时救出他妻子。尼克带录音带回实验室进行分析，葛里森和莎拉留在绑架现场寻求线索。凯瑟林和沃瑞克则开始接手了一件交通肇事案，一个小女孩在公路上被一辆汽车装死，而肇事司机则开着车逃跑了。根据录音带的变调，CSI分析出录音的男人一定站在高从小女孩的压电线旁边，然后又根据被绑架者家里的砂土，葛里森确认了绑架者在金矿工作。于是在高压电线旁的金矿成了重点调查的目标。验尸官从死亡小女孩腿上淤伤，查出了肇事汽车的部分车牌内容。葛里森等人利用热成像仪器，在直升飞机上反复巡视三个金矿，终于探寻到了活埋在地下的被绑架者。同时，布拉斯探长也即时抓获了准备拿取赎金的嫌疑犯。凯瑟林和沃瑞克找到了肇事车，车主人摩尔老头承认了罪行。通过讯问被抢救过来的女事主，CSI探员发现了新的疑点，经过分析绑架者的汽车，最终发现原来绑架案另有隐情。原来被绑架的女事主原先和绑架者串通好，打算讹诈自己丈夫一笔钱后远走高飞，没有想到绑架者另起贪心将她埋进地下。凯瑟林分析了肇事汽车方向盘上的碎牙齿，找出了肇事的真凶－摩尔老头的孙子。摩尔老头原来是为了替孙子顶罪。
4、 湖中女尸
半夜，两个垂钓爱好者发现小船的螺旋桨被卡住，捞出一看，原来是一条女人的大腿。大腿上穿着高跟鞋，显然不是潜水爱好者。经过法医分析，这条大腿是被飞速旋转的螺旋桨切割下来的。同时，一条少掉左大腿的女人尸体被送到了CSI实验室。莎拉和尼克感到一所大学，在一间男生宿舍，一个男大学生上吊而死。讯问该男生的同学，有人说这人是因为没有加入“男生联盟”而自杀。经过比对尸体上的线索，女死者的丈夫暂时被排除了嫌疑。法医罗宾森告诉莎拉，死掉的男大学生不是上吊自杀，而是死后被人放到了绳索上。莎拉和尼克再回学校调查，发现死者可能和“男生联盟”有关。法医罗宾森分析了女死者，得出结论，女人是被强奸杀死之后扔进水中的，并不是被淹死的。通过女死者胃里尚未消化的鱿鱼，CSI探员查到了餐厅并得知女死者有个约会的情夫。尼克和莎拉通过男学生胃中残存的生食，分析出死者在死前被迫吞食过生食，并通过问讯找出了真相。他的同学出于嫉妒，骗死者吞下带着一段绳索的生牛肝，然后他的同学为了掩盖真相伪造了自杀的假相。 找到了女死者生前乘坐的小船，凯瑟林和葛里森最终分析出，女人其实死于一场意外。在和情人约会之后，女人乘船回家，半途中油烧光女人企图发动小船，不小心落水被螺旋桨绞死。等CSI探员打算告诉死者丈夫真相的时候，却发现死者丈夫已经找到情夫家杀死了对方。
5、 夺命狂欢
入夜，一个全身赤裸的少年男子在沙漠里狂奔，好像是被什么恐惧的东西追赶。等CSI找到这个少年，他已经成为浑身爬满蛆的尸体。从死者脸上的恐惧表情可以推断出，该少年死前充满了恐惧。这一集里探员们还需要处理一幢学校校长被杀案，和垃圾场的无名死尸案。法医罗宾森检查了少年的尸体，发现了少量的禁药，但是却不是致死的原因。葛里森根据学术刊物上的论文推断死者可能被吓死。这个观点却无法得到大部分同事的认可，因为吓死在科学的死亡种类之内。由于少年的尸体被太阳曝晒数日，尸体内的水分已经被蒸发干，因此取证成了困难。聪明的葛里森CSI探员，蛆是保存死者尸体里化学物质的最好仓库。 学校创始人里兰女士承认，她是出于自卫打死了校长。但是里兰女士的供词有很多前后矛盾的地方，而且部分供词与现场调查的证据也有矛盾。根据案发现场里血迹，凯瑟林认还有第三者在场。少年身体上的蛆提供了新的线索，死者生前服用过迷幻剂。CSI探员查到了在露天派对出售违禁药品的家伙。少年在露天派对上服用药品之后产生幻觉，以为被人追杀，从而在沙漠里狂奔一直到体力消耗完倒地。垃圾场的尸体来自墓地，贪心的老板将已经埋进地下的棺材挖出埋掉，尸体则随意抛弃。凯瑟林和尼克还是从墙上的血迹得出结论，校长是被人按在地上打死的。
6、 你是谁？
一个爬到地下室修煤气管的男人，偶然间发觉自己家的水泥墙里镶嵌了一只人手。葛里森和尼克用凿子敲开水泥和砖块，在墙体里发现了一具干尸。凯瑟林的前夫卷进了一桩强奸案，凯瑟林因此必须避开这个案子。砖墙里的干尸是一具女性尸骨，尸体被一种弯曲的工具刺过12刀。调查死者身份是第一道难题。一个交通违规者死在了自己的车上，负责交通追击警察说死者是自杀，但是找不到穿过尸体的子弹，因此该警察成了嫌疑人。葛里森从其他城市找来了头骨专家米勒小姐，米勒根据砖墙干尸的头骨复原了死者生前的面孔。 交通死亡案陷入了僵局，相关警察的手枪里少了一颗子弹，警察却说不清楚子弹的去向。米勒复原的头像经过公众电视台发了出去，死者的母亲找到了警察。原来死者是个冲浪、潜水运动员，死者的男友成了嫌疑犯。凯瑟林因为和前夫的关系，陷入了矛盾之中，她不明白是该积极参与案件还是躲开。实验室的检验员格瑞格分析了干尸上残存的砂子，发觉那些都是人造沙砾。莎拉和沃瑞克终于在交通案死者车后的备用轮胎上，找到了致命的子弹，经过分析涉及案件的警察洗清了冤屈。凯瑟林调查出控告前夫的舞女，在案件发生之前服用过避孕药物，从而推翻了强奸的结论。葛里森继续跟进干尸案，在女死者前男友的家中发现了海族鱼缸，里面有相同的人造沙砾。这个男人的妻子出于嫉妒，杀死了被害人。
7、 灭门血案
这集以一桩惨烈的灭门案开局，居住在市中心住宅区的一户人家六口，除了两个女儿都被杀光。两个女孩大的近20岁，小的才7岁。死者状况都非常惨，一家人基本上都被利器刺伤后大量出血而死。死者家中多处被人用血涂上奇怪的环形符号。勘查过现场的葛里森认识了罪案的严重性，他让手下搁下所有罪案全力来办这个灭门案。大女儿由于躲在壁橱里，什么都没有看到。小女儿受到过度惊吓，只说出了“水牛”这个单词。厨房干净整洁，没有一丝血迹，只有放刀的橱柜被打开，少了一把刀。葛里森认定凶杀熟悉房屋结构，之前肯定来过现场。由于该案影响巨大，地方长官和市长都开始关心，CSI探员们遭遇了无比巨大的压力。 大女儿身上的衣服没有一丝血迹，这和她所说的供词产生了极大出入。同时在犯罪现场屋外的摩托车轮胎印，又让探员们把目光聚集到了大女儿的一个男友身上，布拉斯在他家搜出了沾满血迹的牛仔裤。审讯专家开始对该男友进行测慌调查,该男友承认了自己杀了全家人。葛里森仔细检查了死去父亲的项链，发觉了水牛的印记。敏感的葛里森让莎拉对小女儿进行性虐待检查。同时，凯瑟林在对现场血滴的查看之后得出结论，父亲是在走出小女儿房间之后被杀的，而不是之前所认为的进小女儿房间之前所杀。性虐待检查也得出结果，小女儿遭受了大量的虐待。原来，这是一桩家庭暴力导致的惨剧，父亲在强奸大女儿之后使得大女儿生下了现在的“小女儿”。当父亲把魔爪再次伸向小姑娘的时候，大女儿终于忍不住和男友策划了复仇计划。
8、 无名氏
一个男子在家中给自己调了一杯加冰块的酒。随后，镜头切换，CSI探员们来到这个房间。该男子已经在浴缸里开枪自杀，并手持一只录了遗言的录音机。这个案子让葛里森想起了三个月前的案子。（详见第一季第一集）。录音机内的遗言和第一个案子大同小异。沃瑞克和尼克调查的案子比较有趣，一辆从悬崖上摔下来的汽车摔烂，但是只有后座上有一名重伤的中年男人，却没有驾驶员。沃瑞克和尼克根据调查现场，得出了不同的结论。两人为此打了赌，看谁的结论最后被证明是正确的谁就赢五十块钱。 浴缸死者的尸检表明，死者是被人强迫着用枪射杀自己的。沃瑞克和尼克的赌注升级到一百块钱，两人就等昏迷的伤者醒来说出真相。浴缸死亡案的死者，生日相同只差一年。CSI探员推断，下一个凶杀目标是再顺延一年而生日同一天的男人。从录音机上提取的指纹确让大家感到意外，居然是葛里森的。显然是真凶的栽赃，他以此来嘲笑CSI探员拿他没办法。根据新线索，沃瑞克跟尼克进行了新的推断，两人的赌注升到一百五十元。葛里森找到了当初做模型的米兰达，不过米兰达提供不了任何线索。巧的是，第二个死者的信用卡在人死之后有过提款记录。取款机的监控录像显示，是个乞丐用信用卡取了款。医院伤者醒来，经过讯问沃瑞克和尼克了解了真相，两人谁也没有赢。布拉斯找到了老乞丐，老乞丐的口供让人大吃一惊，让乞丐取款的正是米兰达。警局出动大批突击队员进行抓捕活动，不过米兰达家里已经空无一人了,只有米兰达留给葛里森的一张白纸。米兰达本人大摇大摆来到警察局，示威式地在监控摄像头前露了一面。
9、 空中喋血
一架民航客机在即将降落赌场机场前，紧急呼叫地面要求提供医护帮助，随后又要求地面准备好警员以对付突发事件。等飞机降落地面，CSI探员发现，机舱头等舱的过道里躺着一名死者。相关的头等舱旅客及空姐共九人被临时扣押。葛里森让布拉斯协助帮忙，扣留了整架飞机。天一亮，飞机就要被转交给其他部门，犯罪现场的取证工作就无法展开。葛里森调动了全部人马进行调查，他们只有短短的几个小时来调查这桩离奇的高空猝死案。 全组人们在初步检验了犯罪现场之后，分成两拨。一拨调查被扣押的相关人员，问口供以及从他们身上取得相关的现场证据。另外一拨则留在飞机上进行勘查，分析每一个可能的线索以拼凑事发真相。奇怪的是，相关当事人的口供各不相同，每个人都有独自的说法，大家对死者的描述都不大相同。有一点相同的是，死者在临死前由于某种原因大发脾气，招惹了不少人。似乎所有人都对这位死者产生了相当的厌恶感。留在机舱里的葛里森和莎拉根据座位表和现场的迹象，复原了部分真相。最后结合对被扣押者的问讯，CSI探员们大致拼出了真相。死者突发疾病，产生高烧无法正常思考，开始大吵大闹若怒了所有人。大家都对他恶言相加，更进一步激起矛盾。最后在人们的集体粗暴对待下，该人病情恶化导致猝死。真相得到了，但是确无法说具体某人就是杀人凶杀，CSI探员们只能遗憾地看着被扣押的人离开。之后，探员们就谁对谁错产生了激励的争吵，葛里森的总结制止了争吵，让大家陷入了沉思。
10、 性、谎言、谋杀案
一对野营爱好者意外地在树林里发现了一具沾满黄蜂和蛆的尸体。葛里森和莎拉接手此案，其他小组人员则分头去调查一宗名画失踪案件和人员失踪案件。夏洛浦先生半夜被惊醒，发觉是一个偷画贼在偷盗家里的藏画。沃瑞克找到了悬挂失窃名画边上的一个耳朵印记，据此警察找到了耳朵印的主人-夏洛浦先生的小儿子杰森。树林女尸的检查结果表明，该女子有长期遭受虐待的痕迹，并且是被手枪近距离射击而死。根据指纹查到了女尸;的身份，布拉斯找到女人丈夫谢尔顿问话。谢尔顿声称毫不知情，并说没有虐待过老婆。尼克找到了失踪女人的汽车，发现车内有大量快餐食品的包装袋。在谢尔顿家g的搜查，找到了血迹和枪支包裹尸体有关的毯子纤维。 葛里森根据树林女尸上的昆虫推断出了死亡时间，不过这恰恰给谢尔顿洗托了罪名，因为谢尔顿在那段时间内有不在场的证据。葛里森回顾了案情，想到了尸体曾经被毯子包裹，因此用毯子包裹了一头死猪仔进行试验。终于确定了，被包裹的尸体产生各类昆虫的时间，和常规情况下会有所区别。终于重新制定了死亡时间，但是检察官需要更多的证据才能抓捕谢尔顿。莎拉重新检查了女人尸体，从子弹孔附近找到了一些蓝色物质，这些蓝色物质只有谢尔顿子弹上才有，最终结束案。尼克结束了女人失踪案，原来虚惊一场，只是普通的红杏出墙。
11、 15号公路
一名普通的家庭妇女在超市选购，跌落的污渍使得女人跑进洗手间进行擦洗，谁知她就此失踪。探员在洗手间的门上发现了一些隐隐约约的字迹。于是这扇门被搬回CSI实验室。用特殊成像方式冲洗的照片显示，门上写着：我杀了五个女人，来抓我。凯瑟林接手了这个案子。尼克接手的案子，当事人是他以前认识的一个妓女。葛里森没有派任何案子给沃瑞克，因为日班组组长向葛里森打报告，说沃瑞克又进赌场。莎拉接手了一桩普通谋杀案，死者的哥哥目击了蒙面人枪杀他弟弟的过程。哥哥说蒙面人破窗而入，在抢劫财物的时候将弟弟打死。笔迹专家检查了厕所门上的字迹，认定是女人书写。沃瑞克解释了自己去赌场并非赌博，而是另有隐情，葛里森同样他进行调查加入莎拉的案子。凯瑟林找到了分布在其它超市的写着恐吓字样的厕所门，葛里森根据超市地点分析出了凶杀行走路线，并推断出了凶杀的职业和目前行走路线。并最终抓获了以开冷冻货运车为生的卡车杀手，杀手是司机和他的女朋友。两人利用卡车作案。沃瑞克用玻璃窗做了试验，认定哥哥在撒谎，因为弟弟被杀的现场，玻璃其实是从里面被打破的，哥哥承认了自己的罪行。尼克帮妓女朋友解决了麻烦，确引起了警察局内同事的非议。尼克向葛里森说明情况，葛里森嘱咐尼克要注意自己言行。
12、 华氏932度
葛里森接到一盘从监狱里寄出的录像带。一名被控谋杀妻儿的黑人戴蒙向葛里森请求帮助，这位前消防队员说自己绝对没有谋杀妻子和孩子。葛里森决定接手这个案子，进行复查。凯瑟林提醒他，这个案子是日班组做的，小心和日班组的头头埃克里结仇，因为埃克里是个没气量的小人。证据显示，在戴蒙妻子孩子被烧死前一周，戴蒙买了一桶汽油。葛里森感受到了复查的巨大压力。 一名白人男孩从赌场出来，被人用枪打死在汽车里。凯瑟林和尼克在死者车里发现了大量现钞，这些是用力下注的钞票，男孩在干着替人跑腿下注的活。葛里森来到监狱进行重新调查，听戴蒙叙述了失火案当天事情的经过。戴蒙声称自己买汽油是为了给除草机用。曾经在赌场打工替人下注的沃瑞克提供了破案思路，帮助凯瑟林寻找新的侦察方向。葛里森通过实验证明了，戴蒙因为失误打开了燃烧的房门，导致爆炸。戴蒙不愿意别人知道自己作为一个业余消防员，居然违背了基本的消防常识。戴蒙隐瞒了真相这才导致了自己的定罪。沃瑞克等人再次回到火灾现场，经过细致的排查，大家拆开了墙壁，发现火灾的真正原因是电路老化引起的高温点燃了洗手间的易燃液体。凯瑟林调查的男孩枪击案也取得重大进展，最终嫌疑人定在指挥下注的幕后人员。葛里森办案遭到了埃克里的阻挠，葛里森却在和埃克里的争吵中得到启发，查到了易燃液体的来源。从而推翻了戴蒙的谋杀定罪。不过，葛里森也因此遭到了埃克里的嫉恨。
13、 高楼惊爆
一桩写字楼人来人亡很热闹，一名年轻保安看到一个手提箱。在他伸手拿箱子之后，箱子爆炸，年轻保安当场炸死，老保安多米尼手臂受伤。由于爆炸还引发了大火，因此消防队进行了救护工作，大量喷洒的水破坏了现场，给CSI探员的侦察工作带来了难度。葛里森让他的队员们找出炸弹的上万块碎片，将这些碎片拼凑起来，然后寻找线索。尼克看到遭到人纠缠的妓女朋友克里斯蒂，他帮克里斯蒂解决了麻烦并送她回家。之后，尼克没控制住自己和她发生了关系。多米尼主动找到葛里森要求帮助破案，原来多米尼是个“炸弹迷”，精通导索、火药和炸弹的一类知识。不过多米尼那股狂热的想上报纸头条的热情，也让葛里森对他产生了怀疑，尽管如此葛里森还是答应让他参与破案。 尼克早晨路过克里斯蒂的家，发觉她已经被害了，昨天在她家待过的尼克成了最大嫌疑犯。日班组接手此案，日班组的头头埃克里也想借此找葛里森的麻烦。葛里森答应全力帮助尼克解脱嫌疑。葛里森和莎拉根据碎片制造了一些模拟炸弹并进行了模拟爆炸试验，根据碎片的飞溅远近确定了真实炸弹用了镀锌钢管作为填充物。炸弹控时装置将疑点转移到了多米尼身上。从多米尼家搜出了炸弹爆炸后的关键碎片。在多米尼被关押的同时，另外一起相似的炸弹案发生了。莎拉通过炸弹残余碎片上的塑胶颜料查到了出租车工作服，一个被写字楼解雇的经理成了嫌疑犯，最终查得该人的儿子为了替父亲出气制造了炸弹。凯瑟林在克里斯蒂家找到了勒死她的绳索，检验员格瑞格通过绳索上的组织细胞找到了真正的凶手。
14、 脱衣舞男之死
一对父子带着狗在郊外游玩，狗在空旷的地上找到了一块人骨。为了确定该骨是否属于凶杀案留下的骨头，葛里森着召集了大批军校学术在空旷的土地上开始寻找剩余的骨头。经过艰苦复杂的搜寻工作，终于找齐了大部分破碎的骨头。沃瑞克和莎拉接手了一桩舞男猝死案件，莎拉通过给舞男定房间的信用卡，找到了信用卡的主人。原来是一群女人为了庆祝告别单身，而雇了这个舞男，这些女人成了最大嫌疑犯。 凯瑟林请来了葛里森的朋友-头骨专家特丽，葛里森为凯瑟林的自做主张感到恼火。尸骨的主人被确定为70多岁的老人，根据牙医的记录尼克查到骨头主人是1931年出身的梅尔先生。布拉斯到梅尔先生家调查，梅尔太太说梅尔先生去商店了，这不禁让大家怀疑起来。CSI探员搜查了梅尔家，大量照片现实，老夫妻两关系很好。根据试验，特丽确定了给老梅尔先生分尸的电锯。沃瑞克根据法医罗宾森的检验报告，确定那些女人口供为假，那些女人重新修改了口供。沃瑞克和莎拉回到犯罪现场搜查，查到了新的证据。那些女人再次修改了口供，沃瑞克根据口供扣押了重点嫌疑人，最后根据死亡现场遗失的钻石确定了真凶。真凶就是因为嫉妒杀人的即将成为结婚女人的丈夫。特丽分离出了梅尔尸骨里的软组织，尼克分析出梅尔先生被分尸前已经死亡。梅尔太太终于开口说实话了，原来她意外发现了丈夫死亡，于是用电锯将丈夫分尸抛弃在野外，同时继续领取了丈夫的保险金。
15、 豪宅浮尸
社交圈名人海恩斯夫妇组织了一场聚会，与会者有着赌场上流社会的所有人。突然有人惊叫，原来在室外的游泳池里漂浮了一具年轻女性尸体。由于涉及的目击者众多，而且都是重要人物，因此夜班组的成员全部出马进行调查。沃瑞克在游泳池底部发现了一枚徽章，凯瑟林在草丛里发现了一枚假指甲。法医罗宾森检查发现女死者被人用东西勒死，然后抛入水中的，而且死者生前做过整容手术。开聚会的房子属于一位传奇女明星波西亚，波西亚老太目前在欧洲度假。海恩斯夫妇在接受询问的时候说，自己跟波西亚女士关系非常好，所有才被允许借用豪宅开办聚会。 死者被确定是一名在赌场跳舞的舞女。沃瑞克被调离去单独查一件枪击案，他感到非常不高兴。被枪击的男子死在电梯里，沃瑞克发觉死者是被职业杀手干掉的。从舞女的工作场所，葛里森查到了一件原本属于波西亚的音乐盒，对音乐盒出现在舞女处葛里森感到非常困惑。实验员格瑞格调查了舞女体内的精子，发觉和10年前一桩谋杀案联系了起来。疑点集中到了海恩斯夫妇身上。CSI探员们仔细搜查了波西亚夫人的房间，找到的证据显示房间里曾经发生过搏斗，波西亚夫人可能已经遇害。经过历史线索的调查，葛里森终于将横跨多个城市作案犯下多宗罪案的海恩斯夫妇抓捕。而沃瑞克的枪击案陷入僵局，无法破解。
16、 生死一瞬间
一个下雨的黑夜，下班回家的黑人妇女在停车场遭遇歹徒劫持。之后不久，她被人发现抛弃在公路旁边奄奄一息。由于一些日班组成员的辞职，一些案子转移到夜班组，葛里森和他的队员因此变得非常忙碌。沃瑞克接手了一个辗转多年的老案子，嫌疑犯马考尔被控枪杀他的邻居，但是马考尔拒绝认罪，而证据也显示这桩枪杀案有很多解释不通的地方，死者的妻子的证词并没有起到关键作用。凯瑟林因为前夫抵押她名下的房产而感到烦恼，和沃瑞克争吵起来。尼克调查黑人妇女被侵犯案件有了进展，现场遗留的子弹壳帮他联系到了以前的一个案子。 沃瑞克和凯瑟林再次来到马考尔案件的现场，听从了受害人妻子的证词，可是根据证据枪击案还是有一些解释不通的地方。提审马考尔进展不大，马考尔说自己遭到攻击才举枪自卫的。法医罗宾森检查了死者，提醒沃瑞克要更换思考角度。葛里森看莎拉太过投入案子，就提醒她要善于在工作之余放松自己，不要过多把对受害人的同情带进调查工作里去。葛里森利用受害妇女的衣服，让警犬根据气味找到了一个年轻的黑人少年。该少年的裤子上沾了一些血迹。沃瑞克做了多组枪击试验来推算马考尔案的枪击距离，凯瑟林做了一个假人进行模拟试验，终于明白了为什么一颗子弹会打出多个弹孔。尼克检查了现场遗失的布料，发现那些布料来自黑人少年的裤子。不过因为黑人未成年，因此只会被当成少年犯。
17、 失踪的女孩
一对开礼品店的夫妇发现，自己的店被抢劫了，保险柜被掏空，而店里多了一具男人尸体。死者是一名44岁名叫约瑟夫，和该礼品店毫无瓜葛。经过简单勘查之后，CSI探员初步认定这名约瑟夫在盗窃保险柜的时候，被旁人杀死抢走了刚到手的现金。法医罗宾森鉴定约瑟夫被重物敲击致死。凯瑟林在死者头发里发现很多植物孢子，显然是约瑟夫在礼品店后门沾染上的。而对礼品店里取得三十八枚指纹鉴定之后，却得出了一个叫人诧异的结果，其中一枚指纹属于21年前一个被绑架的小女孩玛丽莎。沃瑞克和莎拉开始调查一桩奇特的人体自燃案件，人被烧死在沙发上，不过沙发和其他周围的东西都完好无损。不过信奉科学的莎拉不愿意接受奇异的自燃解释。 尼克根据罕见的切割手法，查到了1999年的一桩保险柜盗窃案，死者正是当初的嫌疑人之一。于是当初案件的合伙人之一理查德，就成了嫌疑犯，恰巧理查德不久前刚刚从监狱里出来。尼克认为理查德是为了报复约瑟夫的检举，而杀害了约瑟夫。葛里森联系到21年前失踪案件的父母，父母带来了小女孩年轻时候的照片。多次帮助葛里森的骨骼专家特丽利用照片模拟了女孩现在的模样，葛里森大吃一惊，居然这就是约瑟夫的女儿谭美。原来当年是约瑟夫拐走了小女孩，并当成自己的女儿抚养到大。凯瑟林从谭美衣服上的孢子证明，当时她也在礼品店的后门出现过。沃瑞克找来一头猪仔进行点燃试验，弄清楚了人体自燃的真相。谭美的亲生父母爱女心切，保释了重要嫌疑人谭美并将其放走。谭美到公车站找到理查德，两人扬长而去。
18、 雨夜迷情
一对庆祝完八周年结婚纪念的谢费尔德夫妻刚从餐馆出来，就遭遇了歹徒的袭击。夫妻俩都被杀死，汽车被歹徒劫持走。夜班组的成员赶到现场不久，天上忽然降雨，CSI探员们紧张地开始拍照取证，不过仍旧有大量证据被雨水冲走。葛里森仰天大喊：便宜凶手了。现场目击者贾斯廷的衣服上沾满了血迹，他解释说是为了抢救死者而沾染上的。canth接手的案子事关一幢倒塌的房屋，三个年老的妇女被压死在屋子之下。法医检查谢费尔德夫妻的尸体之后，认定有两把刀，凶手可能有两人，其中一个是左撇子。 负责调查房屋倒塌的工程师认为房子是自然老化，觉得凯瑟林的调查是大惊小怪多此一举。凯瑟林则坚持要调查个清楚。沃瑞克通过石灰膏从谢费尔德尸体上找出了凶器的大致形状。葛里森找到了谢费尔德夫妇的车，意外地在车里发现了一名年轻女人的尸体。该女名为杰西卡。法医罗宾森从杰西卡尸体里找到了残存的刀碎片，该刀正是杀害谢费尔德夫妇的凶器。凯瑟林坚持要到倒塌房屋的地下勘查，虽然经历了一场惊险的再倒塌，但是总算获得了一些有用的线索。地下的支撑木柱子上，有人为砍过的痕迹。CSI探员们根据血迹的滴溅方向，重新把贾斯廷定为嫌疑犯。凯瑟林根据砍过的木桩和工程师的帮助，也有了进展。最后通过试验，凯瑟林证明了地下每天大量经过的飞机产生共振，使得楼下支柱上的螺丝脱落。再大量的证据面前，贾斯廷交代了这桩离奇买凶杀人案的真相。
19、 人伦惨剧
半夜，住宅区里一户人家的二楼窗户被打开，女主人听见响动到婴儿房查看，发觉婴儿床里的孩子不见了，床上留了一张索取赎金的字条。经过讯问调查，该户人家还有一个10多岁的大儿子和两岁多的儿子。沃瑞克看到二楼窗口的蜘蛛网并没有被扯破，决定绑架者可能不是从二楼出入的。葛里森查到婴儿房里有被掩盖的血迹，怀疑婴儿已经被害。警犬也到了现场，闻过婴儿的衣物之后，警犬散开根据气味开始追踪。在离家不远的地方，警犬发觉了婴儿尸体，被一张小毯子包裹着。法医罗宾森检查过尸体之后，认定婴儿是被人用纤维捂住口鼻窒息而死，并且婴儿的胸部被压碎。 葛里森看到婴儿的惨状，非常愤怒，命令手下人马停止一切案子专心办理婴儿案。婴儿房的血迹被查明是大儿子泰勒的，泰勒解释了原因，说自己是在运动时候弄出的伤口。因为没有接到绑架者的电话，葛里森把疑点转移回婴儿的家人身上。CSI探员在受害人家里开始认真细致的调查。同时赎金索取单上的指纹指向男主人的秘书，而且科学鉴定索取单是从秘书的打印机上打出来的。女秘书承认了和男主人曾经有过暧昧关系，但是不承认绑架并杀害婴儿。排除掉一个个嫌疑犯之后，CSI探员们受心理学家的启发，认定放置婴儿尸体的人，显然非常爱孩子才会包裹上毯子。真相却比所有人想的都要离奇。大儿子泰勒在照顾两个很小的弟弟，结果顽皮的儿子不懂事用软布捂死了婴儿，惊惶失措的泰勒企图给婴儿做人工呼吸压坏了婴儿的胸骨。为了不给儿子带来麻烦，夫妻俩制造了所谓的绑架案。
20、 寂静之声
两位开车兜风的年轻女孩开车压过了一个人的尸体，葛里森到现场勘查之后却发觉被压的人早已经死亡，两位女孩压的只是一具尸体。从尸体上淤伤来看，这人是被一具重型车给压死的。法医鉴定，死者是个聋哑人，线索逐渐缩小。尼克和凯瑟林到咖啡馆调查很惨的枪杀案，死者多达五人，现场看起来是一个持械歹徒把咖啡馆里所有的人都杀死了。探员们初步认定是黑帮仇杀，歹徒目标是杀掉正在咖啡馆的黑帮头子佛林，其他受害人都是无辜的受害者。讯问了咖啡馆老板布拉德，不过布拉德却提供不了什么有用的线索。 沃瑞克和莎拉到聋哑学校来调查，但是学校女校长认为两人不尊重聋哑人，因此拒绝合作，双方闹得不欢而散。略懂一些聋哑语的葛里森再次来到聋哑学校，博得了校长的好感，葛里森也取得了一些有用的线索。沃瑞克从受害人衣服上找到了虱子，而死者非常爱整洁，说明死者生前和头上有虱子的家伙发生过纠纷。因为咖啡店有一死去的女招待怀孕，咖啡店老板布拉德被找来问话，通过重现犯罪现场和比对子弹射击路线，凯瑟林证明了布拉德才是真凶，他因为怀孕事件想除去女店员，黑帮份子只是附带的牺牲者。葛里森则通过虱子、轮胎印记和血液样本查到压死聋哑小孩的凶杀。原来因为聋哑小孩听不见旁人的说话，被凶手误解为高傲自大从而引发纠纷，激发了凶杀的行凶之心。
21、 小心恶犬
一名黄昏后进行短跑联系的年轻男人，在山坡上遭遇了凶狠的野兽袭击。CSI探员来到现场，男人身上有着被严重咬过的痕迹，细心的葛里森发现死者被解剖工具切割过。法医罗宾森检查认定，死者被狗科动物咬过，并且被人用解剖工具取走了部分内脏。凯瑟林因为母爱原因，主动要求接手发生在游乐场的一桩6岁女孩死亡案件。据死者母亲称，在和女儿穿过水帘洞的时候女儿不幸落水，等到游乐场工作人员把死者打捞上来，孩子已经淹死了。游乐场老板不承认有安全隐患，说从未有游客出过事情。凯瑟林发现穿越水帘洞的游览车的安全带很送，不过在做完试验之后发现，安全带松当并不能让孩子落水。相反在水帘洞里面，凯瑟林发现了一把锤子。凯瑟林找到负责修理器械的员工，质问其为什么会把锤子滞留在水帘洞里。激动的凯瑟林认定修理工吸毒之后犯了案，莎拉提醒她不要因为母爱影响对案件的判断。 热心的实验室分析员格瑞格向葛里森提供了思路，葛里森通过兽医和狗学校查到了大型犬的类型。之后，根据现场遗落的牙齿，CSI探员找到了狗的主人苏珊医生。苏珊医生承认了自己养了大狗，但是却否认自己的狗能伤人。葛里森注意到苏珊有丰富的从医经验。检验员格瑞格把检查结果交给凯瑟林，他说修理工偷换了尿样而且这家伙之前有过性犯罪前科。不过证据洗清了这个修理工的嫌疑。凯瑟林重新检查了现场做了模拟试验，结果显示母亲撒谎，其实是她把自己的女儿扔进水里，并用力按进水中淹死。CSI探员再度来到苏珊家进行调查，结果在她家发现了大量的内脏和血液。从苏珊家查获的手术器具显示，上面沾有受害者的鲜血。苏珊最终认罪，自己患有罕见的疾病，必须靠服用大量胰腺素为生。苏珊就利用大狗袭击运动员，然后切割内脏来食用。
22、 无头奇案
夜晚，警用直升飞机和巡逻车在高速公路上狂追一辆飞奔的汽车。等汽车靠近路边停下，警察们却发现车上是两位只穿着内衣的兜风女孩。正当警察们以为是小事一桩的时候，他们意外地在汽车后备箱发现了一颗人头。葛里森决定让凯瑟林和自己调查人头案，同时他让莎拉带领尼克去调查另外一桩沼泽地里发现的弃尸。尼克对葛里森的决定非常不满，他认为自己已经升为三级调查员9个月了，应该有资格单独办案。葛里森说，这其实就是对尼克的磨练，让他耐心一些。沃瑞克接到摩尔老人的求助（详见第一季第三集），说他在监狱里的孙子遭遇了麻烦。沃瑞克来监狱调查，原来摩尔的孙子在监狱里目击了一起帮派仇杀案，帮派成员威胁他不准高密，警察也威胁他必须说实话。 法医罗宾森把人头放进锅里煮烂，从而在头盖骨头上取出了凶器的印记。尼克发现沼泽地里是一具无头尸体，联想到了葛里森主管的人头案，劝说莎拉跨越案件，开始偷偷调查人头案的线索。沃瑞克则开始在监狱进行艰苦的调查工作，根据线索再检验员格瑞格的帮助下，找到了凶杀案的真凶，从而替摩尔老人的孙子避免了一场两头为难的麻烦。沃瑞克教育摩尔的孙子，即使在监狱里也要做个正直的人，不要辜负他的爷爷。骨骼专家特丽，再次被葛里森请来进行无头尸体的鉴定，特丽最终认定腐烂的尸体是一头被剥皮的猩猩。尼克感到非常沮丧，他觉得自己做了一件无用的事情。尼克和莎拉加入到人头案的调查。尼克和凯瑟林找到了属于人头的尸体，在大家的通力协助下案件当然得意告破。葛里森语重心长地告诫尼克，欲速则不达。
23、 辣手摧花客
一个打雷闪电的夜晚，在卧室里熟睡的女子被惊醒。一个穿雨衣戴帽子人手持绳索靠近他。葛里森来到现场进行勘探，他和探长布拉斯分析认定，这是一个连环杀手所为，之前已经发生了数起类似的入室强奸杀人案。凶手的一贯做法是强行入室，然后逼迫受害人服用麻醉药剂，在被害人昏迷之后实施强奸杀人。CSI探员们对房间进行勘查，发觉凶杀非常狡猾，不但清理了所有指纹，而且用吸尘器洗走了现场所有的证据，并拿走了清洁袋。检验员格瑞格通过检测现场精子的DNA，证明了凶杀的确和之前两桩案件的凶杀是同一人。令葛里森烦恼的是，地区长官命令葛里森和他的小组必须和FBI的特派小组一起行动。葛里森在工作过程中，非常不喜欢FBI小组的头头里克。里克根据受害人的外貌特征，说服有相同体貌特征的莎拉做诱饵来引凶杀出现。尽管顾及手下的安慰，葛里森坚决反对莎拉做诱饵，但是莎拉破案心切坚持要求当这个诱饵。 尼克回到犯罪现场搜索证据，遭遇偷偷躲到现场调查的报社记者。布拉斯讯问葛里森有没有可能这个案子和米兰达有关。葛里森追问布拉斯为什么把这两件案子联系到一起，布拉斯说是从FBI来的线索，葛里森非常不高兴。莎拉开始到超市购物，引诱凶手出现。一名和莎拉搭讪男子被警员抓获，但是同时不远处的旅馆里发生了一例相似的杀人案。受害人的丈夫被证明是凶杀，不过葛里森坚持认为这不是前几桩凶杀案的凶手。FBI的的里克认定就是，并开记者招待会宣布结案。凯瑟林劝说葛里森，和人相处的时候要学得圆滑一些。 地区长官给葛里森放了两周假并禁止他回CSI实验室查案子。葛里森的一起鼓励他，并聚集到葛里森家里一起分析文件进行调查。实验员格瑞格通过现场提取的番茄酱，向大家提供了另外一名嫌疑犯。通过这名嫌疑犯，葛里森得知有人买过这名嫌疑犯的精子。沃瑞克调查到，受害的三名女性都去过同一家健身房。葛里森想起一名保安曾经积极要求参与破案。葛里森赶到保安息德家，现场的大量证据表明息德是嫌疑犯。葛里森在地下室遭遇正在洗衣服的息德，正当见事情败露的息德想杀害葛里森的时候，凯瑟林赶到射死了息德。葛里森的组员们终于开心地聚集到一起会餐，享受胜利的喜悦。
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